ImageJ软件在检验医学图像分析处理中的应用

ImageJ软件在检验医学图像分析处理中的应用

ImageJ软件在检验医学图像分析处理中的应用 来源: 鸭绿江医学网

ImageJ是一个用Java语言开发的图像处理和分析平台,具备多种图像处理和分析功能, 下载地址: http: / /rsb1info1nih1gov/ ij/download /win32 / ij1332setup1exe 。该软件是一个免费软件,支持插件技术,而且开放源代码。基于以上原因, ImageJ在医学影像学诊断领域的应用非常广泛,基于该平台的二次开发十分热门,互联网上针对该软件的免费插件很多(下载地址: http: / / rsb1info1nih1gov/ ij/p lugins/index1html) 。笔者查阅大量文献资料,发现有关ImageJ 在检验医学领域应用的资料非常稀少,可见大家对这一优秀的图像处理和分析软件还比较陌生,下面就笔者使用该软件的心得做一总结,并着重就ImageJ 在医学显微图像处理方面(血清蛋白电图谱分析)的应用进行探讨,与同道们交流。

一、软件准备

下载并安装ImageJ: 得益于Java 的跨平台性优势,ImageJ可以运行在L inux、Mac OS和Windows等平台上,这也是该软件的一大优势,是其得以广泛应用的原因之一。ImageJ的运行需要JAVA运行环境(JRE11311或Java 11411SDK)的支持,从官方网站上下载的压缩包中已包含JRE11311。此外, 从SUN 的官方网站(下载地址: http: / /java1sun1com / j2 se / )还可以免费下载各种版本的JAVA运行

环境。运行ImageJ 最少需要64M内存,建议配置256M内存,这样在处理大幅图像或序列图像时就不会有停顿感。

二、实验室准备

11仪器及试剂: BS423型电泳仪(北京生化仪器厂) ;醋酸纤维薄膜(浙江黄岩四青生化材料厂) ;巴比妥2巴比妥钠缓冲液、氨基黑10B染色液、漂洗液和透明液均按全国临床检验操作规程配制; 血清白蛋白标准品( 40g/L, 批号:150081,中生北控生物科技股份有限公司) ; USB摄像头(数码相机或扫描仪成像质量更好)和相应驱动软件。

21方法:制作电泳图谱:电泳方法按照全国临床检验操作规程[ 1 ]进行,电泳完成后以滚动方式将薄膜平贴于洁净无划痕的载玻片上(薄膜较多时可贴在大块无色玻璃板上) ,将此载玻片衬以白纸置于USB摄像头前采集图谱(灰度图像即可) ,存入微机备用。

三、实验分析:

分析电泳图谱: (1)启动ImageJ ,打开采集的图像。用方形图像选择工具在图像上圈定一个电泳图谱(注意要将各个条带都全部框住) , 然后按1 键(相应的菜单操作为:Analyze→Gels→Select First Lane) ,标记和选定该电泳图谱。如果一幅图像上有多个电泳图谱,将鼠标放在该方框的中央,按住鼠标拖动方框(注意不要改变方框大小)将其放在下一个电泳图谱上,按2键(相应的菜单操作为: Analyze→Gels→Select Next Lane) ,分别标记和选定这些电泳图谱。(2)所有电泳图谱都标记完毕后,按3键(相应的菜单操作

为:Analyze→Gels→Plot Lanes)生成所有选定电泳图谱的光密度分布曲线。用直线工具在每一条曲线上划一条基线,使得曲线上的每一个波峰都能与基线围成一个封闭区域。如果生成的曲线较多,可以用手形工具上下移动图像执行此操作。

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